В 2012 году Российский фонд фундаментальных исследований и Европейская лаборатория молекулярной биологии (EMBL) приняли решение о поддержке шести международных проектов, направленных на создание инновационных лекарственных препаратов. Уже сейчас учеными достигнуты интереснейшие результаты, исследования по всем грантам активно продолжаются.
О предварительных итогах совместного конкурса РФФИ и EMBL рассказывает заведующий лабораторией инженерной энзимологии химического факультета МГУ им. М.В.Ломоносова академик РАМН Алексей ЕГОРОВ.
— Алексей Михайлович, вы принимали активное участие в расширении международного сотрудничества РФФИ и, в частности, в подготовке соглашения с EMBL. Как родилась идея совместного конкурса?
— Европейская лаборатория молекулярной биологии — это в определенном смысле аналог всем известного международного научного центра в Дубне. В нее входят 20 европейских государств и страна-партнер — Австралия. По количеству научных публикаций и индексу цитирования в области молекулярной биологии EMBL занимает четвертое место в мире и первое в Европе. Организация поддерживает почти 100 проектов по разным направлениям исследований.
В настоящий момент наша страна официально не является членом EMBL, что, впрочем, не мешает нам успешно сотрудничать. Около 30 российских научных групп участвуют в проектах EMBL в качестве партнеров.
Важным шагом стало подписание в 2011 году официального соглашения между РФФИ и EMBL, в соответствии с которым фонд получил право участвовать в организации совместных исследований.
Мы выбрали серьезного партнера, и это открыло очень много новых возможностей. Это касается и самих исследований, и публикаций в престижных международных журналах, и коммерциализации научных результатов.
Подписанию соглашения о сотрудничестве предшествовали две конференции: в Германии и в России. В прошлом году прошел первый конкурс, поступило 12 заявок, половина из них получила поддержку. Третья конференция, состоявшаяся в этом году, была посвящена итогам кон-курса.
— Всего дюжина заявок? Не маловато?
— В конкурсе участвовали только группы, уже имеющие связи с EMBL и опыт работы над международными проектами. Мы пошли на это сознательно, по договоренности с европейскими партнерами.
— Что дает нашим ученым подобное сотрудничество?
— В рамках соглашения появилась возможность не только проведения совместных исследований, но и постановки, продвижения тех или иных научных проблем. Это само по себе крайне важно. Наших ученых регулярно приглашают поработать на уникальном оборудовании в лабораториях EMBL, расположенных в Гамбурге, Гренобле, Хайдельберге и других европейских крупных научных центрах.
Также важен психологический фактор. Сотрудничество накладывает жесткие обязательства. Есть план, есть график, спустя рукава не поработаешь. Полезны многие совместные мероприятия: симпозиумы, конференции, конгрессы, на которых идет активный обмен мнениями. В этом году прошло большое научное заседание, где слушались отчеты по каждому из проектов. Все перезнакомились, сформировался такой своеобразный научный клуб.
Этим летом с 6 по 11 июля состоится еще одно важное мероприятие — Конгресс Федерации европейских биохимических обществ (FEBS-2013). Это уникальное событие, как Олимпийские игры, только для биохимиков. В нашей стране такой конгресс проходил лишь однажды — в 1984 году. Ждем в гости все руководство EMBL, будем обсуждать дальнейшие перспективы сотрудничества.
— Расскажите, пожалуйста, о поддержанных проектах.
— В совместных исследованиях участвуют ученые нескольких институтов РАН и факультетов Московского университета. Со стороны европейских партнеров одним из инициаторов программы сотрудничества является заместитель руководителя отделения EMBL в Гамбурге Виктор Ламзин, а я — с российской стороны.
Среди поддержанных работ — проект лаборатории биохимической генетики Института молекулярной генетики РАН “Эпигенетический контроль генов, осуществляемый с участием коротких РНК у насекомых”, которым руководит заведующий Отделом молекулярной генетики клетки ИМГ РАН академик Владимир Гвоздев. Полученные в ходе исследований результаты могут быть использованы для изучения эпигеномных раковых модификаций хроматина в опухолях человека.
Другой проект — совместная работа групп кандидата биологических наук Всеволода Белоусова из Института биоорганической химии им. М.М.Шемякина и Ю.А.Овчинникова РАН и Карстен Шульц (Carsten Schultz) из EMBL, изучающих механизмы передачи окислительных и липидных сигналов в клетке. Есть надежда, что исследование приведет к разработке лекарственных препаратов, направленных на системы продукции активных форм кислорода.
Еще одна работа — совместный проект лаборатории биокатализа Института биоорганической химии РАН и EMBL, направленный на изучение структурно-функционального взаимодействия в искусственных ферментах. Руководит исследованием член-корреспондент РАН Александр Габибов. Использование богатейшей кристаллографической базы EMBL и предложенных нашими учеными методик позволило получить ответы на многие фундаментальные вопросы, связанные со структурой и активностью антител. В современной медицине широко используются лекарственные препараты на основе антител, и результаты данного исследования имеют очевидное прикладное значение.
Перспективный проект EMBL и лаборатории химии нуклеотидов химического факультета МГУ им. М.В.Ломоносова посвящен изучению структурной характеристики белков теломеразного комплекса H. Polymorpha, что очень важно для понимания механизмов деления клеток. Руководитель исследования — заведующая кафедрой химии природных соединений МГУ член-корреспондент РАН Ольга Донцова. Полученные в ходе проекта данные должны открыть принципиально новые возможности для разработки противоопухолевых препаратов.
Интересен проект коллектива академика РАН Павла Георгиева из Института биологии гена РАН и лаборатории EMBL в Хайдельберге “Идентификация новых транскрипционных регуляторов раннего эмбрионального развития”. Изучение механизмов, определяющих эмбриональное развитие, закладку тканей, позволит быстрее раскрыть секреты регуляции генетических процессов.
Ну и несколько слов о проекте нашей лаборатории инженерной энзимологии химического факультета МГУ “Поиск новых ингибиторов бета-лактамаз для преодоления бактериальной резистентности к антибиотикам”, направленном на формирование новых подходов к преодолению антибиотикорезистентности (способности микроорганизмов — возбудителей инфекционных заболеваний вырабатывать устойчивость к действию антибиотиков). Российской группой ученых руководит кандидат химических наук Виталий Григоренко.
Честно признаюсь: если бы мы делали эту работу самостоятельно, без европейских партнеров, на нее ушло бы 20 лет. И неизвестно, был бы результат или нет. А так мы за год совершили огромный рывок. EMBL уже представляет наши результаты на международных выставках.
Создаваемые в рамках совместного проекта вещества являются ингибиторами ферментов, которые разрушают антибиотики. Их использование повышает эффективность действия лекарств.
Работа большая, она разделена между двумя группами. В Германии профессионально делают то, что они умеют, а мы выполняем свою часть исследований. При этом наблюдаем явный синергетический эффект: дело движется на удивление быстро.
Наши партнеры из EMBL разработали компьютерную программу, с помощью которой из банка данных, содержащего восемь миллионов молекул, отбираются необходимые нам препараты. В итоге им удалось найти 550 молекул.
Для исследования активности этих молекул используется робот, который разливает в специальные емкости наработанную в нашей лаборатории генно-инженерную лактамазу и добавляет к ней молекулы из числа отобранных. Выясняем, как они влияют на лактамазу. На этом этапе отбор уже гораздо строже. В нашем случае его прошли лишь пять молекул. Представляете, какая статистика: пять из восьми миллионов!
Далее с помощью компьютерного моделирования определяем, как эти молекулы связываются с ферментом лактамазой, детально изучаем их взаимодействие. Выясняется, что из пяти веществ активны два: зато активность у них выше, чем у тех, что сейчас используются в фармацевтике.
Вообще считается, что для создания нового лекарства нужны 10 лет и миллиард долларов. В рамках проекта удалось за один год найти две высокоактивные молекулы. С точки зрения токсичности они не опасны. И, следовательно, перспективны для использования в медицине.
Кстати, сейчас наработанный в нашей лаборатории фермент используется в Германии для получения кристаллов и рентгеноструктурного анализа. Это очень тонкая работа. Лактамаза постоянно мутирует и меняет свою структуру, но есть участки, которые остаются постоянными. Мы ищем универсальный ингибитор, действующий как раз на эти постоянные участки, продолжаем поиск и изучение новых высокоактивных молекул.
— Взаимодействие с EMBL будет продолжаться?
— Да. Наши коллеги очень довольны сотрудничеством и заинтересованы в его развитии. Все совместные проекты направлены на создание инновационных лекарственных препаратов, и у нас есть весомые результаты. Многие из них уже представляются на престижных международных фармацевтических выставках.
Бытует мнение, что наши ученые
в Академии наук никогда не думали об эффективности их исследований,
об экономике… Глупости, всегда мы об этом думали! Было такое слово — “внедрение”. Теперь это называется “трансфер технологий”.
Под эгидой EMBL функционирует специализированная организация Enterprise Management Technology Transfer GmbH (EMBLEM), которая занимается очень широким кругом вопросов — патентованием, организацией совместных компаний, передачей технологий, продажей лицензий, в общем, коммерциализацией науки. Очень
разумно все сделано, нам следовало бы перенять этот опыт.
В этом году работы продолжатся в существующих рамках. А в будущем надеемся получить новые гранты по совместной программе ориентированных фундаментальных исследований РФФИ и EMBL.
Екатерина Саруль
РФФИ
Нет комментариев